MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 5819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002679	GCAGG	2	10	275315	275324	20 %	0 %	60 %	20 %	13488362
4502	NC_002679	GC	3	6	275446	275451	0 %	0 %	50 %	50 %	13488140
4503	NC_002679	GCA	2	6	275477	275482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488140
4504	NC_002679	GCA	2	6	275491	275496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488140
4505	NC_002679	GA	3	6	275518	275523	50 %	0 %	50 %	0 %	13488140
4506	NC_002679	TGC	2	6	275536	275541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488140
4507	NC_002679	TGC	2	6	275556	275561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488140
4508	NC_002679	GC	3	6	275741	275746	0 %	0 %	50 %	50 %	13488140
4509	NC_002679	TCCC	2	8	275772	275779	0 %	25 %	0 %	75 %	13488141
4510	NC_002679	TCC	2	6	275892	275897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488141
4511	NC_002679	GCC	2	6	275915	275920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488141
4512	NC_002679	GCC	2	6	276159	276164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488141
4513	NC_002679	CCG	2	6	276232	276237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488141
4514	NC_002679	CCA	2	6	276249	276254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488141
4515	NC_002679	TGAG	2	8	276266	276273	25 %	25 %	50 %	0 %	13488141
4516	NC_002679	ACG	2	6	276276	276281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488141
4517	NC_002679	ACG	2	6	276347	276352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488141
4518	NC_002679	GC	3	6	276363	276368	0 %	0 %	50 %	50 %	13488141
4519	NC_002679	TGC	2	6	276369	276374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488141
4520	NC_002679	TGG	2	6	276375	276380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488141
4521	NC_002679	GC	3	6	276400	276405	0 %	0 %	50 %	50 %	13488141
4522	NC_002679	CGC	2	6	276410	276415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488141
4523	NC_002679	TCG	2	6	276417	276422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488141
4524	NC_002679	CGC	2	6	276451	276456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488141
4525	NC_002679	CGG	2	6	276477	276482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488141
4526	NC_002679	CG	3	6	276517	276522	0 %	0 %	50 %	50 %	13488141
4527	NC_002679	CAA	2	6	276550	276555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488141
4528	NC_002679	CGA	2	6	276619	276624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488141
4529	NC_002679	TGC	2	6	276652	276657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488141
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4531	NC_002679	TGC	2	6	276704	276709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488142
4532	NC_002679	GGC	2	6	276766	276771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488142
4533	NC_002679	TCG	2	6	276791	276796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488142
4534	NC_002679	CGAGAA	2	12	276807	276818	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	13488142
4535	NC_002679	CGTT	2	8	276836	276843	0 %	50 %	25 %	25 %	13488142
4536	NC_002679	TGG	2	6	276881	276886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488142
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4539	NC_002679	GGC	2	6	276990	276995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488142
4540	NC_002679	CGGG	2	8	277048	277055	0 %	0 %	75 %	25 %	13488142
4541	NC_002679	AAT	2	6	277068	277073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488142
4542	NC_002679	ATG	2	6	277121	277126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488142
4543	NC_002679	CGG	2	6	277222	277227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488143
4544	NC_002679	GGTCCT	2	12	277261	277272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4545	NC_002679	TCC	2	6	277344	277349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488143
4546	NC_002679	TTC	3	9	277386	277394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488143
4547	NC_002679	AGG	2	6	277399	277404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488143
4548	NC_002679	CCTT	2	8	277455	277462	0 %	50 %	0 %	50 %	13488143
4549	NC_002679	GGC	2	6	277532	277537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488143
4550	NC_002679	GCCG	2	8	277545	277552	0 %	0 %	50 %	50 %	13488143
4551	NC_002679	TCC	2	6	277572	277577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488143
4552	NC_002679	CGG	2	6	277603	277608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488143
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4554	NC_002679	GC	3	6	277751	277756	0 %	0 %	50 %	50 %	13488143
4555	NC_002679	AGC	2	6	277848	277853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4556	NC_002679	GTC	2	6	277865	277870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4557	NC_002679	GC	3	6	277881	277886	0 %	0 %	50 %	50 %	13488143
4558	NC_002679	ATC	2	6	277926	277931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488143
4559	NC_002679	ACG	2	6	277974	277979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4560	NC_002679	ATC	2	6	277982	277987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488143
4561	NC_002679	GCC	2	6	278034	278039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488143
4562	NC_002679	CGAC	2	8	278053	278060	25 %	0 %	25 %	50 %	13488143
4563	NC_002679	ACAT	2	8	278082	278089	50 %	25 %	0 %	25 %	13488143
4564	NC_002679	AC	3	6	278122	278127	50 %	0 %	0 %	50 %	13488143
4565	NC_002679	CACGC	2	10	278180	278189	20 %	0 %	20 %	60 %	13488143
4566	NC_002679	CTG	2	6	278216	278221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488143
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4568	NC_002679	TCG	2	6	278265	278270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488143
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4570	NC_002679	GCG	2	6	278354	278359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488143
4571	NC_002679	CCA	2	6	278384	278389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488143
4572	NC_002679	CTT	2	6	278423	278428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488143
4573	NC_002679	TCA	2	6	278445	278450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488143
4574	NC_002679	CTG	2	6	278477	278482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488143
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4577	NC_002679	AGCGCC	2	12	278574	278585	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13488143
4578	NC_002679	CG	3	6	278633	278638	0 %	0 %	50 %	50 %	13488143
4579	NC_002679	GCT	2	6	278659	278664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488143
4580	NC_002679	GCC	2	6	278699	278704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488143
4581	NC_002679	GCC	2	6	278804	278809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488143
4582	NC_002679	CAG	3	9	278867	278875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488143
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4585	NC_002679	TGGC	2	8	280087	280094	0 %	25 %	50 %	25 %	13488144
4586	NC_002679	GCG	2	6	280152	280157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488144
4587	NC_002679	CG	3	6	280183	280188	0 %	0 %	50 %	50 %	13488144
4588	NC_002679	CTT	2	6	280265	280270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488144
4589	NC_002679	CTT	2	6	280310	280315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488144
4590	NC_002679	CAGG	2	8	280405	280412	25 %	0 %	50 %	25 %	13488144
4591	NC_002679	CTTA	2	8	280433	280440	25 %	50 %	0 %	25 %	13488144
4592	NC_002679	CGG	2	6	280480	280485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488144
4593	NC_002679	GGT	2	6	280489	280494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488144
4594	NC_002679	TTC	2	6	280499	280504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488144
4595	NC_002679	CGC	2	6	281555	281560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488145
4596	NC_002679	AGG	2	6	281576	281581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488145
4597	NC_002679	CCT	2	6	281597	281602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488145
4598	NC_002679	CGCT	2	8	281626	281633	0 %	25 %	25 %	50 %	13488145
4599	NC_002679	GCG	2	6	281678	281683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488145
4600	NC_002679	GGT	2	6	281685	281690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488145
4601	NC_002679	TGG	2	6	281735	281740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488145
4602	NC_002679	CCG	2	6	281794	281799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488145
4603	NC_002679	CCTT	2	8	281821	281828	0 %	50 %	0 %	50 %	13488145
4604	NC_002679	TCA	2	6	281858	281863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488145
4605	NC_002679	GC	3	6	281864	281869	0 %	0 %	50 %	50 %	13488145
4606	NC_002679	ACC	2	6	281908	281913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488145
4607	NC_002679	TCA	3	9	282037	282045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488145
4608	NC_002679	CG	3	6	282054	282059	0 %	0 %	50 %	50 %	13488145
4609	NC_002679	CTGG	2	8	282150	282157	0 %	25 %	50 %	25 %	13488145
4610	NC_002679	TCC	2	6	282175	282180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488145
4611	NC_002679	CCG	2	6	282183	282188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488145
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4613	NC_002679	GC	3	6	282247	282252	0 %	0 %	50 %	50 %	13488298
4614	NC_002679	GCC	2	6	282262	282267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488298
4615	NC_002679	GATC	2	8	282287	282294	25 %	25 %	25 %	25 %	13488298
4616	NC_002679	GAC	3	9	282297	282305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488298
4617	NC_002679	ACA	2	6	282316	282321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488298
4618	NC_002679	AGC	2	6	282375	282380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488298
4619	NC_002679	GCGCA	2	10	282418	282427	20 %	0 %	40 %	40 %	13488298
4620	NC_002679	GAT	2	6	282428	282433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488298
4621	NC_002679	T	6	6	282433	282438	0 %	100 %	0 %	0 %	13488298
4622	NC_002679	CGA	2	6	282500	282505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488298
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4624	NC_002679	AGC	2	6	282583	282588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488298
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4994	NC_002679	GGC	3	9	302717	302725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488302
4995	NC_002679	GGT	2	6	302732	302737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488302
4996	NC_002679	CGG	3	9	302743	302751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488302
4997	NC_002679	GGT	2	6	302765	302770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488302
4998	NC_002679	GC	4	8	303294	303301	0 %	0 %	50 %	50 %	13488303
4999	NC_002679	TGA	2	6	303341	303346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488303
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